首先是大陸曆前數年，就在人類的文化皆達頂盛之時，鬥爭心強烈的人類為了自身以及國家間的利益，掀起了無數的戰爭，如傳染病般的戰禍隨著參與國家的增多而越演越烈，戰國時代般的亂世就這麼展開。
而就在這亂世後的１６年，尚未平息的戰爭被突如其來的可怕力量打破了均衡… 
古龍之神‧梅薾菲！那個帶來席捲整個大陸恐怖力量的少女，是這麼自稱的。
在強勢的古龍軍團侵襲整個大陸之下，這片土地剩下的，只有絕望與黑暗…

但，希望永遠存在。 
南方的聖亞里昂王國遭到古龍軍團侵略時，王國軍裡的騎士─漢彌爾竟一劍砍下古龍頭顱，這個打破古龍軍團不敗傳說的奇蹟，帶給人類勢力莫大勇氣與希望。就在這一仗之後，在聖亞里昂王國與漢彌爾的號召下，散落於各地的勇者們紛紛聚集於亞里昂王國，以偉大的主神奧丁之名，正式起義與古龍軍團一決死戰！
但同時，古龍軍團的統帥「古龍之神．梅薾菲」，竟是漢彌爾當年於海拉爾村、尚未成為王國騎士前的妻子蘇菲一事，卻也跟著不脛而走，人們開始猜忌這只是一場巨大的騙局，只是梅薾菲與漢彌爾為了侵略世界而演出的一場戲。為避免好不容易凝聚起來的向心力和希望破滅，漢彌爾決定遠離人群，但討伐古龍的決心依然深植在他的內心，不曾動搖。深知目前人類力量不足以殲滅古龍的漢彌爾，前往精靈樹海尋求由六大聖靈率領的遠古妖精協助，希望能借取祂們的力量與古龍軍團抗衡。漢彌爾在千辛萬苦終於得到六大聖靈的支援，並帶著這股力量來到了梅薾菲居住的「古龍之城」，開始了最後的決戰。

堅持信念的騎士漢彌爾，在犧牲了所有一切，包含自己壽命的那一劍沒入了曾經的摯愛─梅薾菲的軀體後，結束了自己與妻子的一生，在賢者狄亞斯和亞蒂瑪眼前，梅薾菲和漢彌爾的屍身漸漸消逝於光中。
終於，人類又再一次得到了生存的機會……
一年後，就在古龍之神的災難終於過去後，重建了各自家園的新生國家舉行了第一次大陸國家會議。在亞蒂瑪的主持中，除了追封已逝英雄漢彌爾「英雄王」稱號外，更同時宣佈了此年為「大陸曆元年」。
但在這件事情過後，「米多加爾德」並沒有維持太久的和平！很快的，另外一場災難的巨浪又再次淹沒了整個大陸…

第二段災難是距今兩百多年前，被稱為冥界戰爭的那段過往。
這場第二次的人類浩劫起因在於「冥界巨山」發生大地震崩落，冥界女王赫拉率領冥界軍團衝出禁錮所致。 
當時的聖亞里昂皇女－菲茵朵菈受天命所啟而手持聖劍「因凡特拉」率領人類，力阻冥軍進犯，但區區人類畢竟不是冥界軍團的對手，幾次的交戰下，人類漸漸不敵那股來自冥界的力量…
節節敗退的菲茵朵菈，最後在魯那的神官－妮法妮斯繼承絲寇蒂主魂成為現世之神絲寇蒂後，有了最佳的依靠。在絲寇蒂所率領的「戰靈軍團」協助下，菲茵朵菈總算不再孤獨無助，歷史逝去的英雄伙伴們隨著她為阻止冥界軍團而前進至「虹之橋」。

為讓人類與戰靈們獲得最大力量抗衡冥軍，菲茵朵菈在絲寇蒂的幫助下，以聖劍「茵凡特菈」砍破了大地上所有曾被諸神所封印的「神柱石」禁錮。「神柱石」是貫通天、人、冥三界的「世界晶石」，它掌管「世界秩序」的流動，簡而言之，在這區域中，掌握神柱石即能自由的改變該區域的「世界秩序」。而菲茵朵菈在得到絲寇蒂之助後，使用「神柱石」來改變的即是「讓人類擁有如神族般無止盡的力量」這個「世界秩序」；當世界之力溢滿大地，冥軍在世界之力的干涉下漸趨轉弱，世界之力同時不斷強化人類與戰靈的力量，交戰後第一次，人類終於看到了勝利與希望的曙光！
最後，就在四個月的連續爭戰下，菲茵朵菈終於以聖劍「因凡特拉」砍落了附身於人類的冥界女王頭顱，魔軍見狀紛紛落荒而逃，此時的菲茵朵菈卻也受了致命的重傷，就這麼躺在血泊中，仰望著久違的和平曙光輕輕微笑…

而繼承了絲寇蒂主魂的妮法妮斯，不捨菲茵朵菈就這麼輕易的離開這個世界，因此引領身受致命重傷的聖劍皇女菲茵朵菈前往神界永居，成為新任的「戰女神」，這場將近半年之久的戰爭，終於在人類與戰靈的勝利中畫下句點。
兩段浩劫結束後，和平與希望終於回到了「米多加爾德」這塊土地的人們手中，但完全沒人察覺，這些只是眾多陰謀的冰山一角，黑暗下的陰影依然在覬覦著…
「米多加爾德」的人們，抱著各自不同的想法的五個國家，在此時開始了新的故事…